Ерлан Нысанбаев окончил Казахский сельскохозяйственный институт и Казахский национальный педагогический университет имени Абая. Трудовую деятельность начал в 1983 году мастером Уйгурского лесного хозяйства в Алматинской области.
В 1991-2004 годах работал в структуре коммерческих организаций. С 2004 по 2009 года занимал руководящие должности в АО "Астана-Зеленстрой". В 2009 году Ерлан Нысанбаев возглавил Комитет лесного и охотничьего хозяйства.
В разное время был заместителем министра окружающей среды и водных ресурсов, заместителем министра сельского хозяйства и заместителем министра экологии, геологии и природных ресурсов.
С 2021 по 2023 года работал в должности заместителя председателя правления по стратегическому развитию и международным связям Казахского агротехнического университета имени Сейфуллина.
С марта 2023 года работал советником акима Астаны. 5 сентября 2023 года Президент Касым-Жомарт Токаев назначил Ерлана Нысанбаева министром экологии и природных ресурсов.