Айдарбек Сапаров окончил Омский сельскохозяйственный институт и Северо-Казахстанский государственный университет имени Козыбаева.
Трудовую деятельность начал в 1984 году бухгалтером совхоза. Работал в коммерческих структурах. С 2003 года занимал должности в Северо-Казахстанском областном представительстве АО "Продкорпорация".
В 2006 году стал акимом района Шал акына Северо-Казахстанской области. В 2008 году акимом района Магжана Жумабаева. В 2010 году назначен заместителем акима Северо-Казахстанской области по сельскому хозяйству. В 2011 году стал первым заместителем акима СКО.
С 2019 по 2022 год работает первым вице-министром сельского хозяйства. С 1 декабря 2022 года занимал должность акима Северо-Казахстанской области. 4 сентября 2023 года Президент Касым-Жомарт Токаев назначает Айдарбека Сапарова министром сельского хозяйства.