Бейбит Исабаев окончил Казахский государственный университет ("журналист") и Дипломатическую академию МИД РК. ("специалист-международник"). Имеет дипломатический ранг посла, кандидат политических наук.
Трудовую деятельность начал в 1985 году редактором программы "Алатау" Казахского телевидения. С 1987 по 1994 год работал в различных СМИ. Был главным редактором газет "Өркен" – "Горизонт", генеральным директором Казахской государственной телерадиовещательной компании.
С 1994 по 1997 год занимал различные руководящие должности в акимате Алматы, был заместителем акима города (при Шалбае Кулмаханове).
Позже работал в Министерстве иностранных дел и канцелярии премьер-министра.
С 2002 по 2003 год – советник министра и посол по особым поручениям в МИД. С 2003 года стал послом Казахстана в Пакистане, Турции и Албании по совместительству.
С 2008 по 2009 год – вице-министр культуры и информации, затем пресс-секретарь Президента Казахстана.
С 2009 по 2019 года - посол Казахстана в Кыргызстане и Азербайджане. В 2019 году был руководителем представительства Президента в Парламенте, затем стал сенатором.
11 июня 2022 года Касым-Жомарт Токаев назначил Бейбита Исабаева акимом области Жетысу.